日喀则是西藏交通中心，境内公路四通八达，318国道、日（喀则）亚（东）公路、拉（萨）普（兰）公路、中尼公路贯通东西南北。由新路前往日喀则距离250公里。拉萨每天07：00-12：00，在公路纪念碑旁的长途汽车站有长途汽车（私营小巴）开往日喀则，客满即开，票价38元，行车约需8小时。拉萨汽车站也有大巴前往，但行车时间较长，车票也较贵。
　　航空：日喀则没有机场，一切依靠拉萨贡嘎机场，距离日喀则市约400公里左右，并需乘长途汽车到曲水转车前往。详情可参阅拉萨航空交通。
　　陆路：由日喀则开往各地的公营长途汽车比拉萨所发车辆少，只开往拉萨及萨迦的有定期班次前往，亚东每日或隔日上午均有长途汽车前往，班次及时间视乘客人数而定。
　　包车是大多数旅客首选的交通方式，参考价格为：普通型进口越野车3.00-3.50元/每公里；豪华型进口越野车3.50-4.50元/每公里；可供20人乘坐的微型汽车5.50-6.50元/每公里；可供40人乘坐的长途汽车7.00-8.00元/每公里。
　　私营长途汽车行走日喀则至江孜及日喀则至拉孜、拉萨等地。前往江孜或拉孜的旅客注意，每日清晨至15：00，汽车站外均有私营中型长途汽车开往两地。要前往拉萨，在贡觉林路的工商局对面候车，或直接在街头等候即可，因为小客车会在街上兜客。前往拉孜的乘客可在清晨06：00-21：00在扎什伦布寺外的广场西侧等候。所有车辆均要坐满客才开出，所以客车有可能因旅客人数不足而临时取消行程。
　　日喀则不大，在市内步行就很方便。三轮车每人2－3元，可议价。的士在市内一律收费10元。