亦称新教、耶稣教，有别於罗马天主教及源自希腊的东正教。基督教在近代第一位来华传道的是马礼逊(Robert　Morrison)，他属英国伦敦传道会，1807 年9月4日抵澳，开始他在华的传教生涯。他在澳门的宗教活动，代表基督教新教和英国伦敦传道会在中国传教的初期所获得的重大成就。马礼逊曾在澳门翻译《圣经》，主张以“浅白及简易文字”将新旧约译成中文，对後来中国教会的传教与译经事业影响至钜。马礼逊在澳门出版颇多中英文的神学与语言学着述，皆在中国新教传教史上十分重要。1820年他又与李文斯敦医生(Dr.J.Living-Stone)在澳门开设一间诊所，同时有一中医，实行赠医施药；1827年得郭雷枢医生(Dr.Thomas R.Colledge)之助，於澳门开办一间眼科医院。马礼逊在广东受到中国人的排斥，在澳门亦受到葡人及天主教徒的歧视，但继续传教，由此可见马礼逊於基督教及伦敦传道会，实为一大功臣。历史上尚有许多别的新教教会传教士受了马礼逊的影响而来到澳门传教。例如在中国沿海地区布道的传教士郭士立(Karl　Friedich　August Gutzlaff)，即属荷兰传道会，後脱离该会，自由传教。其夫人在澳门开办第一所女子私立学校，名伦敦妇女会女校；1835年9月马礼逊纪念学校创办，即附设於此校内，至1839年马礼逊纪念学校正式设校(又名马礼逊学堂)，成为澳门最早之基督教学校，曾培育过容闳、黄胜、唐杰、黄宽等後来在历史上有名的学生。1845年後，德国系统的教团如巴色会、礼贤会、巴陵会、信义会等皆接受郭士立的主张，联合在华传道；又有美部会，亦称美国公理会，於1830年即有裨治文(E.C.Bridgman)来澳门传教；其後更有崔理时、卫叁畏(Samuel Wells Williams)等人於1833年至澳门传道；1839年有戴华尔来澳；1841年有波乃耶自新加坡抵澳；1842年有娄理华至澳，後北上宁波传教。至於美国浸信传道会、美南浸信会、美国圣公会、美国长老会海外传道会、加拿大长老会等，亦先後派遣传教士至澳门传教。由於澳门葡人及天主教徒的排斥，1842年香港开埠後，大部分教会皆离开澳门，其中伦敦传道会、浸信会及马礼逊教育协会皆迁往香港，美部会则以广州为基地，其馀各传道会则分往中国内地及各口岸传教，皆有所发展。至1917年10月4日，澳门中华基督教会为其教堂奠基立碑，始标志基督教的重临澳门。1997年澳门有基督教组织或会所数十个，基督徒人数近5000 人。